Różnorodność genetyczna parwowirusów izolowanych z klinicznych przypadków choroby od psów w Polsce
Uzyskane sekwencje izolatów własnych wykazywały wzajemną homologię rzędu 98,5-100%. Podobieństwo sekwencji nukleotydowych fragmentów genu VP2 uzyskanych w badaniach własnych z analogicznym fragmentem amplifikowanym z wirusów szczepionkowych wynosiło 98,5-99,3% dla szczepionki Intervet, 98,5-99,3% dla Merial, 98,7-99,4% dla Pfizer, 98,9-99,4% dla Quantum, 98,9-99,4% dla Biocan i 98,9-99,4% dla Versican.
Tab. 1. Szczepy CPV z bazy GenBank, których sekwencje genetyczne genów VP2 porównywano z sekwencjami izolatów własnych
Analiza filogenetyczna szczepów wirusa uzyskanych od psów grupy szczepionej pozwoliła wykazać obecność w populacji tych zwierząt 6 grup monofiletycznych CPV. Najliczniejsza utworzona została przez sześć izolatów (nr 11, 24, 25, 27, 34 i 26) i wykazywała największą homologię (99,5%) z sekwencją szczepu CPV2b izolowanego z obszaru Turcji (KF500499). Kolejną grupę utworzył jeden szczep (nr 22), który największe podobieństwo badanej sekwencji genu (99,4%) wykazywał z CPV2b izolowanym na obszarze Korei (EU009206). W trzeciej grupie znalazły się cztery izolaty (nr 3, 17, 19, 39), które największą homologię (99,8-100%) wykazywały ze szczepem japońskim (AB054220). Grupa czwarta, podobnie, jak i druga, została utworzona przez jeden izolat (nr 31), który okazał się być homologiczny (100%) ze szczepami greckimi CPV2c: (GQ865518 i GQ865519), hiszpańskim (FJ005214) i amerykańskim (FJ005235). W grupie piątej znalazły się trzy izolaty (nr 13, 14, 18), wykazujące najwyższą homologię (99,3-99,4%) ze szczepem indyjskim CPV2b (DQ182623). Ostatnią grupę tworzył jeden izolat (nr 15) wskazujący najwyższe podobieństwo badanej sekwencji genu (99,8%) z izolatem włoskim CPV2a (FJ 005252). Reasumując, można stwierdzić, że izolaty parwowirusa izolowane od psów szczepionych, u których doszło do rozwoju choroby, w większości przypadków (14/16) zakwalifikowano jako CPV2b, jeden jako CPV 2a i jeden jako CPV2c (ryc 1).
Analiza filogenetyczna szczepów wirusa uzyskanych ...
Dostęp ograniczony.
Pełen dostęp do artykułu tylko dla zalogowanych użytkowników z wykupioną subskrypcją.
zaloguj sięlub
zarejestruj sięMogą zainteresować Cię również
Znajdź swoją kategorię
2640 praktycznych artykułów - 324 ekspertów - 22 kategorii tematycznych
Weterynaria w Terenie
Niezakaźne przyczyny chorób kończyn u świń
Problem kulawizn u loch Kulawizny u loch są, tuż po problemach w rozrodzie, najważniejszą przyczyną brakowań loch z dalszej hodowli. Najwięcej przypadków obserwuje się w okresie od odsadzenia do momentu porodu. Bardzo często schorzenia kończyn są rejestrowane u pierwiastek lub u loch po drugim porodzie, a więc w okresie, kiedy wchodzą one w najbardziej wydajny […]
Posocznica cieląt wywołana przez E. coli. Kolisepticemia
Zapobieganie W przypadku zachorowań na kolisepticemię należy brać pod uwagę przede wszystkim dwa czynniki: niski poziom immunoglobulin w surowicy krwi oraz system odchowu cieląt sprzyjający zakażeniom patogennymi szczepami E. coli (14, 17, 18). Wiele czynników ma wpływ na transfer immunoglobulin siarowych. Jednak najważniejszą rolę odgrywają czas, w jakim zostanie podana siara po urodzeniu, oraz ilość […]
Niezakaźne przyczyny chorób kończyn u świń
Problem kulawizn u loch Kulawizny u loch są, tuż po problemach w rozrodzie, najważniejszą przyczyną brakowań loch z dalszej hodowli. Najwięcej przypadków obserwuje się w okresie od odsadzenia do momentu porodu. Bardzo często schorzenia kończyn są rejestrowane u pierwiastek lub u loch po drugim porodzie, a więc w okresie, kiedy wchodzą one w najbardziej wydajny […]
Kiedy warto zlecić rozmaz krwi u koni?
Z drugiej strony należy jednak mieć na uwadze niską czułość tej metody – wynik ujemny nie jest podstawą wykluczenia choroby. Zarówno w przypadku anaplazmozy, jak i babeszjozy odsetek zakażonych krwinek może być bardzo niski, a okres, w którym będzie możliwa ich mikroskopowa identyfikacja, krótki (4, 8). Co za tym idzie, w razie wyniku ujemnego u […]
Wskazówki na wypadek widocznego niepowodzenia terapii antybiotykowej. Kryteria skutecznej terapii oraz kluczowe pytania jako 5 kroków drzewa analitycznego
Czynniki powiązane z użyciem antybiotyku w terapii: Czy wybór antybiotyku opierał się na badaniach klinicznych i dodatkowych (diagnoza, antybiogram)? Sprawdź odpowiedź na pytanie 3. Farmakokinetyka/farmakodynamika wybranego antybiotyku? Koncentracja i czas działania antybiotyku w zakażonej tkance a efektywność w stosunku do czynnika bakteryjnego wywołującego chorobę (spektrum działania antybiotyku, wrażliwość z antybiogramu – odpowiedzi na pytanie 3.). […]
Czarno na białym – mastitis okiem praktyka – rozmowa z dr. n. wet. Sebastianem Smulskim
Rozmowa z dr. n. wet. Sebastianem Smulskim, pracownikiem Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, specjalistą w dziedzinie profilaktyki i leczenia mastitis u krów, który w swoich badaniach zgłębia tematykę zapalenia gruczołu mlekowego u bydła, zarówno w aspekcie naukowym, jak i praktycznym. Większość zapaleń gruczołu mlekowego ma etiologię bakteryjną. Dlaczego, pomimo rozwoju mikrobiologii, medycyny weterynaryjnej i prowadzonych badań, […]
XVIII FORUM ZOOTECHNICZNO-WETERYNARYJNE: NOWE HORYZONTY W ROZRODZIE ZWIERZĄT
Na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu w dniach 18-19 kwietnia br. odbyło się XVIII Forum Zootechniczno-Weterynaryjne pod hasłem „Rozród zwierząt w dobie selekcji genomowej”. To wydarzenie zgromadziło liczne grono lekarzy weterynarii oraz hodowców, by omówić najnowsze osiągnięcia w dziedzinie hodowli i rozrodu zwierząt. Organizacja Forum była wspólnym przedsięwzięciem Poznańskiego Koła Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, Wielkopolskiego Oddziału Polskiego […]
Wiosną zapisz się do bezpłatnego newslettera!
Bądź na bieżąco z nowościami z branży weterynaryjnej.
