Najnowsze trendy i zmiany paradygmatów w branży patologii cyfrowej
W odpowiedzi na coraz szerszą akceptację sztucznej inteligencji trendy w branży patologii cyfrowej zaczynają się zmieniać.
- Firmy zajmujące się analizą obrazu porzucają klasyczne metody i manualnie dopasowywane algorytmy analizy obrazu i zmieniają je na metody uczenia głębokiego. Integrują je w istniejące systemy komputerowe za pomocą otwartego interfejsu programistycznego (ang. application programming interface, API) i umożliwiają integrację oraz użytkowanie z zakupionym już oprogramowaniem lub tworzą nowe, niezależne programy.
- Coraz więcej firm dostarcza oprogramowanie jako usługę (ang. software as a service, Saas) zamiast tradycyjnego oprogramowania instalowanego na komputerze. Aby umożliwić użytkownikom, którzy nie dysponują wystarczającą mocą obliczeniową w swoich laboratoriach, efektywne korzystanie z modeli uczenia głębokiego, firmy oferują możliwość analizy obrazu i przetwarzania danych w chmurze oraz interfejsy użytkownika, do których można uzyskać dostęp przez przeglądarkę internetową.
- Jeszcze do niedawna sprzedawcy oprogramowania do analizy obrazów preparatów mikroskopowych projektowali systemy zamknięte, analizujące dane za patologów i niedające im możliwości wpływu na przebieg analizy. Teraz podejście się zmieniło i nowe programy mają na celu wspomaganie patologów oraz naukowców w podejmowaniu decyzji opartych na danych pochodzących z obrazu, a nie wyręczanie ich z ich zadań. Daje im to o wiele większą kontrolę nad procesem diagnostycznym, gdyż mogą oni zaakceptować lub odrzucić sugestie oprogramowania. Ostatecznie to patolog jest odpowiedzialny za stawianą diagnozę, niezależnie, czy miał pomoc ze strony oprogramowania, czy nie.
- Oprogramowania do patologii cyfrowej i analizy obrazu stają się coraz bardziej przyjazne dla użytkownika.
Integracja uczenia głębokiego
Nie jest tajemnicą, że oprogramowanie do klasycznej analizy obrazu, niezależnie, czy o otwartym kodzie źródłowym (ang. open source), czy dostępne komercyjnie, nie jest zbyt przyjazne dla użytkownika. Wielopoziomowe rozwijane menu w interfejsie użytkownika nie jest intuicyjne i aby dostać się do pojedynczej funkcji programu, trzeba często rozwinąć kilka z nich z rzędu.
Nauka posługiwania się takim programem jest żmudna i długotrwała, i jeśli program nie jest używany dostatecznie często, umiejętność jego używania szybko zanika. Hierarchiczne, rozwijane menu to cena, jaką płaci się za udostępnianie skomplikowanych funkcji analizy obrazu użytkownikom, którzy nie posiadają umiejętności programowania komputerowego. Im więcej opcji jest dostępnych dla użytkownika, tym mniej przejrzysty staje się interfejs programu.
Jakby samo użytkowanie programu nie było dostatecznie skomplikowane, użytkownik musi dodatkowo ręcznie wybrać i dopasować parametry, na podstawie których ma być oparta analiza. Ponadto ręczny wybór parametrów ogranicza i nie sprawdza się, jeśli np. barwienie preparatów nie jest jednorodne lub też gdy w grę wchodzą inne zmienne (grubość preparatu, kontrast barwienia, stosunek sygnału do tła w przypadku immunohistochemii itp.).
Mogą zainteresować Cię również
Znajdź swoją kategorię
2608 praktycznych artykułów - 324 ekspertów - 22 kategorii tematycznych
Weterynaria w Terenie
Podkliniczny niedobór wapnia i jego wpływ na wyniki rutynowych badań laboratoryjnych w różnych okresach laktacji u krów mlecznych
Obserwacje epizootiologiczne oraz wyniki badań klinicznych, anatomopatologicznych i laboratoryjnych prowadzonych w chlewniach średnio- i wielkotowarowych, w których stwierdzano nagłe zachorowania – z ostrymi objawami ze strony układu oddechowego, przede wszystkim wśród warchlaków i tuczników – wskazują, że ich przyczyną dość często bywa pleuropneumonia świń. Czynnikiem etiologicznym tej choroby są drobnoustroje Actinobacillus pleuropneumoniae (App). Cechą charakterystyczną […]
Podkliniczny niedobór wapnia i jego wpływ na wyniki rutynowych badań laboratoryjnych w różnych okresach laktacji u krów mlecznych
Obserwacje epizootiologiczne oraz wyniki badań klinicznych, anatomopatologicznych i laboratoryjnych prowadzonych w chlewniach średnio- i wielkotowarowych, w których stwierdzano nagłe zachorowania – z ostrymi objawami ze strony układu oddechowego, przede wszystkim wśród warchlaków i tuczników – wskazują, że ich przyczyną dość często bywa pleuropneumonia świń. Czynnikiem etiologicznym tej choroby są drobnoustroje Actinobacillus pleuropneumoniae (App). Cechą charakterystyczną […]
Szerzenie się, profilaktyka i terapia ważnych ekonomicznie chorób układu oddechowego świń (pleuropneumonia, mykoplazmowe zapalenie płuc)
Choroby układu oddechowego świń są ważnym problemem zdrowotnym i – w konsekwencji – ekonomicznym w chowie świń. Przyczyny wysunięcia się tej grupy chorób na czoło problemów zdrowotnych to, przede wszystkim, mająca miejsce w Europie około 30 lat temu zmiana systemu chowu świń z drobnotowarowego na średnio- i wielkotowarowy oraz potęgujący się z roku na roku […]
Wprowadzenie do stomatologii koni
Problemy stomatologiczne i wynikające z ich obecności przeszkody w prawidłowym użytkowaniu koni są jedną z częstszych przyczyn interwencji lekarzy weterynarii specjalizujących się w tej dziedzinie. Dowiedziono, że po diagnostyce kulawizn, szczepieniach, diagnostyce i leczeniu chorób układu rozrodczego, badanie przed kupnem/sprzedażą zajmuje najwięcej czasu praktykującym lekarzom weterynarii (1). Ewolucyjna droga od żyjącego we wczesnym Eocenie Hyracotherium […]
Wskazówki na wypadek widocznego niepowodzenia terapii antybiotykowej. Kryteria skutecznej terapii oraz kluczowe pytania jako 5 kroków drzewa analitycznego
Czynniki powiązane z użyciem antybiotyku w terapii: Czy wybór antybiotyku opierał się na badaniach klinicznych i dodatkowych (diagnoza, antybiogram)? Sprawdź odpowiedź na pytanie 3. Farmakokinetyka/farmakodynamika wybranego antybiotyku? Koncentracja i czas działania antybiotyku w zakażonej tkance a efektywność w stosunku do czynnika bakteryjnego wywołującego chorobę (spektrum działania antybiotyku, wrażliwość z antybiogramu – odpowiedzi na pytanie 3.). […]
Czarno na białym – mastitis okiem praktyka – rozmowa z dr. n. wet. Sebastianem Smulskim
Rozmowa z dr. n. wet. Sebastianem Smulskim, pracownikiem Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, specjalistą w dziedzinie profilaktyki i leczenia mastitis u krów, który w swoich badaniach zgłębia tematykę zapalenia gruczołu mlekowego u bydła, zarówno w aspekcie naukowym, jak i praktycznym. Większość zapaleń gruczołu mlekowego ma etiologię bakteryjną. Dlaczego, pomimo rozwoju mikrobiologii, medycyny weterynaryjnej i prowadzonych badań, […]
XVIII FORUM ZOOTECHNICZNO-WETERYNARYJNE: NOWE HORYZONTY W ROZRODZIE ZWIERZĄT
Na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu w dniach 18-19 kwietnia br. odbyło się XVIII Forum Zootechniczno-Weterynaryjne pod hasłem „Rozród zwierząt w dobie selekcji genomowej”. To wydarzenie zgromadziło liczne grono lekarzy weterynarii oraz hodowców, by omówić najnowsze osiągnięcia w dziedzinie hodowli i rozrodu zwierząt. Organizacja Forum była wspólnym przedsięwzięciem Poznańskiego Koła Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, Wielkopolskiego Oddziału Polskiego […]