Nowy system klasyfikacji sekwencji ORF5 wirusa zespołu rozrodczo-oddechowego świń 1 (PRRSV-1)
Streszczenie
PRRSV-1 występuje głównie w Europie, ale obecny jest także w Ameryce Północnej i Azji. Dotychczasowe systemy klasyfikacji genetycznej oparte na sekwencji ORF5 były niespójne. Nowy system klasyfikacji PRRSV-1 zaproponowano na podstawie analizy 10 446 sekwencji ORF5 z lat 1991-2023. Wyróżniono cztery linie genetyczne (L1-L4), z czego linia L1 obejmuje 18 podlinii o zróżnicowanym rozmieszczeniu geograficznym.
W Polsce wykazano obecność ośmiu z nich. Przeanalizowano także pozycję filogenetyczną komercyjnych szczepionek PRRSV-1.
Zaproponowany system stanowi podstawę do dalszych badań epidemiologicznych i standaryzacji globalnej klasyfikacji PRRSV-1.
Słowa kluczowe
PRRSV-1, ORF5, klasyfikacja genetyczna, linie genetyczne, epidemiologia molekularna, filogeneza
Abstract
PRRSV-1 occurs predominantly in Europe but is also present in North America and Asia. Previous ORF5-based genetic classification systems were inconsistent. A novel PRRSV-1 classification system was proposed based on the analysis of 10,446 ORF5 sequences collected between 1991 and 2023. Four genetic lineages (L1-L4) were identified, with lineage L1 comprising 18 sublineages showing distinct geographic distributions.
Eight of these have been detected in Poland. The phylogenetic positions of commercially available PRRSV-1 vaccines were also analyzed. The proposed system provides a framework for epidemiological studies and supports global standardization of ORF5-based PRRSV-1 classification.
Keywords
[...]
którzy są subskrybentami naszego portalu.
i ciesz się dostępem do bazy merytorycznej wiedzy!
POSTĘPOWANIA
w weterynarii
